L'expertise comptable des professionnels de santé, de l'installation à la cession

Le praticien qui exerce à titre individuel relève en principe des bénéfices non commerciaux : une comptabilité de recettes et de dépenses, un registre des immobilisations et une déclaration n° 2035, ou le micro-BNC tant que ses recettes restent sous le seuil légal. Il n'établit pas de bilan, ce qui change la façon de présenter un dossier à une banque. Ses soins sont exonérés de TVA ; les redevances qu'il perçoit d'un collaborateur ne le sont pas.

La société d'exercice libéral à l'impôt sur les sociétés tient une comptabilité d'engagement, avec bilan et liasse fiscale. L'officine, elle, est un commerce : achats, stock, marge, TVA à plusieurs taux. Trois cadres, trois manières de lire les chiffres — et de les piloter. La société civile de moyens, qui partage locaux et personnel sans exercer, s'ajoute souvent à l'un ou l'autre.

• Expert-comptable pharmacie
• SEL et SPFPL

Depuis l'imposition des revenus de l'année 2024, la rémunération qu'un associé de société d'exercice libéral perçoit au titre de son activité libérale est en principe imposée dans la catégorie des bénéfices non commerciaux, et non plus comme un salaire. La rémunération des fonctions de gérance suit, elle, son propre régime.

Cette doctrine administrative a des conséquences pratiques : obligations déclaratives de l'associé, frais professionnels, acomptes d'impôt, articulation avec les cotisations sociales. Toute comparaison entre exercice individuel et société établie avant 2024 est à refaire.

• SEL et SPFPL : le détail

Les cotisations des praticiens et auxiliaires médicaux libéraux sont désormais calculées sur une assiette unique : le revenu professionnel avant cotisations, diminué d'un abattement forfaitaire de 26 %. En micro-BNC, c'est l'abattement fiscal de 34 % qui s'applique aux recettes. La réforme, appliquée aux revenus de 2025, a produit ses premiers effets sur les régularisations de 2026.

Les échéanciers de l'URSSAF, et progressivement ceux des caisses de retraite, ne se comparent donc plus terme à terme avec ceux des années antérieures. Un écart ne signale pas forcément une erreur : il se vérifie, puis se provisionne dans la trésorerie.

• Médecin libéral
• Kinés et paramédicaux

Les décisions s'enchaînent dans un ordre qui compte. D'abord le projet et son lieu, qui conditionnent les aides et le niveau d'activité attendu. Ensuite le prévisionnel, qui dit ce que le projet peut supporter comme emprunt et comme prélèvements personnels. Enfin le cadre juridique et fiscal, choisi en connaissance des chiffres.

Choisir la structure en premier, parce qu'un confrère l'a fait, revient à répondre avant d'avoir posé la question. Le cabinet intervient de préférence avant toute signature : bail, contrat de collaboration, promesse de cession ou statuts, que votre avocat ou votre notaire rédige, se lisent aussi avec leurs conséquences comptables et fiscales.

• Installation et association
• Rachat et cession de cabinet